当在控制不佳的实验室或现场条件下处理聚合物时，溶液的稳定性变得更加复杂。由于溶液可能在高温下暴露数周或数月，粘度损失严重。特别是对于高分子量聚合物，在高速搅拌和超声波作用等高剪切应力作用下，其分子量和粘度会降低。

与其他水溶性聚合物化合物一样，聚丙烯酰胺水溶液的稳定性随着老化几天或几周而降低。人们提出了许多原因来解释与初始链断裂无关的粘度损失，其中最合理的解释似乎是粘度的降低是由链构象的变化引起的流体机械体积的逐渐减小引起的。新溶解的聚合物含有硬块，硬块是由分子内氢键环和螺旋结构组成的刚性链段，是稳定的。
然而，由于熵的作用，氢键慢慢离解并重新形成，使大分子更光滑，线圈更小，流体的机械体积和粘度更小。这将降低其有效性。均聚物在制造、储存和运输过程中受到仔细控制，并放置在50℃或更低的温度下，不会显著损失分子量或降低粘度。
目前，没有足够的证据来确定 聚丙烯酰胺水溶液的稳定性是否受到微生物在溶液中消耗PAM的影响。然而，微生物经常在溶液中生长，特别是当溶液被污染时，它会从最初的透明变为浑浊，甚至沉淀。当分子量超过1.5 X 106时，在75℃或更高的老化温度下，粘度损失和分子量下降将同时发生。